Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf4Q9NQ89 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf4Q9NQ89 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf4Q9NQ89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf4Q9NQ89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf4Q9NQ89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C12orf4Q9NQ89 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf4Q9NQ89 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf4Q9NQ89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf4Q9NQ89 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf4Q9NQ89 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf4Q9NQ89 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C12orf4Q9NQ89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf4Q9NQ89 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf4Q9NQ89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms