Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL40Q9NQ50 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPL40Q9NQ50 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL40Q9NQ50 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL40Q9NQ50 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL40Q9NQ50 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL40Q9NQ50 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL40Q9NQ50 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL40Q9NQ50 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL40Q9NQ50 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL40Q9NQ50 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL40Q9NQ50 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL40Q9NQ50 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL40Q9NQ50 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL40Q9NQ50 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL40Q9NQ50 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL40Q9NQ50 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL40Q9NQ50 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL40Q9NQ50 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL40Q9NQ50 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL40Q9NQ50 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL40Q9NQ50 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL40Q9NQ50 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPL40Q9NQ50 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL40Q9NQ50 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms