Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST11Q9NPF2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST11Q9NPF2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST11Q9NPF2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST11Q9NPF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST11Q9NPF2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST11Q9NPF2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST11Q9NPF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST11Q9NPF2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST11Q9NPF2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST11Q9NPF2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST11Q9NPF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST11Q9NPF2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST11Q9NPF2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST11Q9NPF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST11Q9NPF2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST11Q9NPF2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST11Q9NPF2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST11Q9NPF2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST11Q9NPF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms