Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMG20AQ9NP66 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20AQ9NP66 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20AQ9NP66 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20AQ9NP66 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20AQ9NP66 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20AQ9NP66 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20AQ9NP66 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20AQ9NP66 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20AQ9NP66 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20AQ9NP66 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20AQ9NP66 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20AQ9NP66 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20AQ9NP66 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20AQ9NP66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20AQ9NP66 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20AQ9NP66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20AQ9NP66 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20AQ9NP66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20AQ9NP66 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMG20AQ9NP66 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMG20AQ9NP66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20AQ9NP66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20AQ9NP66 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms