Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rabgef1Q9JM13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabgef1Q9JM13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabgef1Q9JM13 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabgef1Q9JM13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabgef1Q9JM13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabgef1Q9JM13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabgef1Q9JM13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabgef1Q9JM13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabgef1Q9JM13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rabgef1Q9JM13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rabgef1Q9JM13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rabgef1Q9JM13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rabgef1Q9JM13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms