Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cabp2Q9JLK4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Cabp2Q9JLK4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cabp2Q9JLK4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cabp2Q9JLK4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cabp2Q9JLK4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cabp2Q9JLK4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cabp2Q9JLK4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cabp2Q9JLK4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cabp2Q9JLK4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Cabp2Q9JLK4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cabp2Q9JLK4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cabp2Q9JLK4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cabp2Q9JLK4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cabp2Q9JLK4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cabp2Q9JLK4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cabp2Q9JLK4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cabp2Q9JLK4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cabp2Q9JLK4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cabp2Q9JLK4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cabp2Q9JLK4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cabp2Q9JLK4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Cabp2Q9JLK4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cabp2Q9JLK4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cabp2Q9JLK4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cabp2Q9JLK4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cabp2Q9JLK4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cabp2Q9JLK4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cabp2Q9JLK4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cabp2Q9JLK4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cabp2Q9JLK4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cabp2Q9JLK4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cabp2Q9JLK4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cabp2Q9JLK4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cabp2Q9JLK4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cabp2Q9JLK4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cabp2Q9JLK4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cabp2Q9JLK4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cabp2Q9JLK4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cabp2Q9JLK4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cabp2Q9JLK4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cabp2Q9JLK4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Cabp2Q9JLK4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cabp2Q9JLK4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cabp2Q9JLK4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cabp2Q9JLK4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cabp2Q9JLK4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Cabp2Q9JLK4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cabp2Q9JLK4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cabp2Q9JLK4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cabp2Q9JLK4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cabp2Q9JLK4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Cabp2Q9JLK4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cabp2Q9JLK4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cabp2Q9JLK4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cabp2Q9JLK4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cabp2Q9JLK4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms