Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI3

Mmel1, Membrane metallo-endopeptidase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmel1Q9JLI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mmel1Q9JLI3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mmel1Q9JLI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mmel1Q9JLI3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mmel1Q9JLI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mmel1Q9JLI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmel1Q9JLI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Mmel1Q9JLI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mmel1Q9JLI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mmel1Q9JLI3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmel1Q9JLI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmel1Q9JLI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mmel1Q9JLI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mmel1Q9JLI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmel1Q9JLI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmel1Q9JLI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmel1Q9JLI3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmel1Q9JLI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Mmel1Q9JLI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mmel1Q9JLI3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Mmel1Q9JLI3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmel1Q9JLI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmel1Q9JLI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmel1Q9JLI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mmel1Q9JLI3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mmel1Q9JLI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Mmel1Q9JLI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mmel1Q9JLI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mmel1Q9JLI3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmel1Q9JLI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mmel1Q9JLI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mmel1Q9JLI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mmel1Q9JLI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mmel1Q9JLI3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms