Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacng3Q9JJV5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacng3Q9JJV5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacng3Q9JJV5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacng3Q9JJV5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacng3Q9JJV5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacng3Q9JJV5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacng3Q9JJV5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacng3Q9JJV5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacng3Q9JJV5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacng3Q9JJV5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacng3Q9JJV5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacng3Q9JJV5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacng3Q9JJV5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacng3Q9JJV5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacng3Q9JJV5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacng3Q9JJV5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacng3Q9JJV5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacng3Q9JJV5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacng3Q9JJV5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacng3Q9JJV5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacng3Q9JJV5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacng3Q9JJV5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacng3Q9JJV5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacng3Q9JJV5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacng3Q9JJV5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacng3Q9JJV5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacng3Q9JJV5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacng3Q9JJV5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacng3Q9JJV5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacng3Q9JJV5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cacng3Q9JJV5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacng3Q9JJV5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng3Q9JJV5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng3Q9JJV5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacng3Q9JJV5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacng3Q9JJV5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacng3Q9JJV5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacng3Q9JJV5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacng3Q9JJV5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacng3Q9JJV5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacng3Q9JJV5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacng3Q9JJV5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacng3Q9JJV5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms