Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Oxct2aQ9JJN4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Oxct2aQ9JJN4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Oxct2aQ9JJN4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Oxct2aQ9JJN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Oxct2aQ9JJN4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Oxct2aQ9JJN4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Oxct2aQ9JJN4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Oxct2aQ9JJN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Oxct2aQ9JJN4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Oxct2aQ9JJN4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Oxct2aQ9JJN4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Oxct2aQ9JJN4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Oxct2aQ9JJN4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Oxct2aQ9JJN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Oxct2aQ9JJN4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Oxct2aQ9JJN4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Oxct2aQ9JJN4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Oxct2aQ9JJN4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Oxct2aQ9JJN4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Oxct2aQ9JJN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Oxct2aQ9JJN4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Oxct2aQ9JJN4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Oxct2aQ9JJN4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Oxct2aQ9JJN4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Oxct2aQ9JJN4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Oxct2aQ9JJN4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Oxct2aQ9JJN4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Oxct2aQ9JJN4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Oxct2aQ9JJN4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Oxct2aQ9JJN4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Oxct2aQ9JJN4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Oxct2aQ9JJN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Oxct2aQ9JJN4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Oxct2aQ9JJN4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Oxct2aQ9JJN4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Oxct2aQ9JJN4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Oxct2aQ9JJN4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms