Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCC2Q9HCC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCC2Q9HCC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC2Q9HCC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC2Q9HCC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC2Q9HCC0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCC2Q9HCC0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCC2Q9HCC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC2Q9HCC0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCC2Q9HCC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC2Q9HCC0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC2Q9HCC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCC2Q9HCC0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC2Q9HCC0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms