Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q3

PRDM13, PR domain zinc finger protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM13Q9H4Q3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM13Q9H4Q3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM13Q9H4Q3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM13Q9H4Q3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM13Q9H4Q3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM13Q9H4Q3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM13Q9H4Q3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM13Q9H4Q3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM13Q9H4Q3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM13Q9H4Q3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM13Q9H4Q3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM13Q9H4Q3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM13Q9H4Q3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM13Q9H4Q3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM13Q9H4Q3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM13Q9H4Q3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM13Q9H4Q3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM13Q9H4Q3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM13Q9H4Q3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM13Q9H4Q3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM13Q9H4Q3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM13Q9H4Q3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms