Protein–RNA interactions for Protein: Q9H329

EPB41L4B, Band 4.1-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4BQ9H329 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPB41L4BQ9H329 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPB41L4BQ9H329 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPB41L4BQ9H329 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPB41L4BQ9H329 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L4BQ9H329 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L4BQ9H329 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EPB41L4BQ9H329 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EPB41L4BQ9H329 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41L4BQ9H329 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L4BQ9H329 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4BQ9H329 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4BQ9H329 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4BQ9H329 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4BQ9H329 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4BQ9H329 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L4BQ9H329 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPB41L4BQ9H329 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L4BQ9H329 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L4BQ9H329 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms