Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X6

HIPK2, Homeodomain-interacting protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK2Q9H2X6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK2Q9H2X6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK2Q9H2X6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK2Q9H2X6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK2Q9H2X6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK2Q9H2X6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK2Q9H2X6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK2Q9H2X6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK2Q9H2X6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK2Q9H2X6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK2Q9H2X6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK2Q9H2X6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK2Q9H2X6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK2Q9H2X6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK2Q9H2X6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms