Protein–RNA interactions for Protein: Q9H201

EPN3, Epsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPN3Q9H201 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPN3Q9H201 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EPN3Q9H201 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPN3Q9H201 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPN3Q9H201 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPN3Q9H201 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EPN3Q9H201 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPN3Q9H201 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPN3Q9H201 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPN3Q9H201 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EPN3Q9H201 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPN3Q9H201 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPN3Q9H201 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPN3Q9H201 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPN3Q9H201 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EPN3Q9H201 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPN3Q9H201 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPN3Q9H201 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPN3Q9H201 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPN3Q9H201 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPN3Q9H201 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms