Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH19Q9H159 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH19Q9H159 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH19Q9H159 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH19Q9H159 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH19Q9H159 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH19Q9H159 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH19Q9H159 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH19Q9H159 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH19Q9H159 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH19Q9H159 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH19Q9H159 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH19Q9H159 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH19Q9H159 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH19Q9H159 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH19Q9H159 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH19Q9H159 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH19Q9H159 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH19Q9H159 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH19Q9H159 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH19Q9H159 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH19Q9H159 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH19Q9H159 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDH19Q9H159 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH19Q9H159 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH19Q9H159 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CDH19Q9H159 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH19Q9H159 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDH19Q9H159 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDH19Q9H159 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDH19Q9H159 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDH19Q9H159 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH19Q9H159 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms