Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC22A4Q9H015 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC22A4Q9H015 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC22A4Q9H015 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC22A4Q9H015 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A4Q9H015 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC22A4Q9H015 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC22A4Q9H015 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A4Q9H015 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A4Q9H015 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A4Q9H015 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A4Q9H015 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A4Q9H015 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A4Q9H015 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A4Q9H015 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A4Q9H015 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A4Q9H015 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A4Q9H015 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms