Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDEL1Q9GZM8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDEL1Q9GZM8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDEL1Q9GZM8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDEL1Q9GZM8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDEL1Q9GZM8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDEL1Q9GZM8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDEL1Q9GZM8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDEL1Q9GZM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDEL1Q9GZM8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDEL1Q9GZM8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDEL1Q9GZM8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDEL1Q9GZM8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDEL1Q9GZM8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDEL1Q9GZM8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms