Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YIPF3Q9GZM5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YIPF3Q9GZM5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF3Q9GZM5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YIPF3Q9GZM5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YIPF3Q9GZM5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YIPF3Q9GZM5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YIPF3Q9GZM5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YIPF3Q9GZM5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YIPF3Q9GZM5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YIPF3Q9GZM5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YIPF3Q9GZM5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF3Q9GZM5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF3Q9GZM5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF3Q9GZM5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF3Q9GZM5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF3Q9GZM5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF3Q9GZM5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF3Q9GZM5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
YIPF3Q9GZM5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YIPF3Q9GZM5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YIPF3Q9GZM5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF3Q9GZM5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YIPF3Q9GZM5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YIPF3Q9GZM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF3Q9GZM5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF3Q9GZM5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF3Q9GZM5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms