Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall1Q9ER74 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall1Q9ER74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall1Q9ER74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall1Q9ER74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Sall1Q9ER74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Sall1Q9ER74 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sall1Q9ER74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sall1Q9ER74 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall1Q9ER74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall1Q9ER74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall1Q9ER74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall1Q9ER74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall1Q9ER74 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sall1Q9ER74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sall1Q9ER74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sall1Q9ER74 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sall1Q9ER74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sall1Q9ER74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sall1Q9ER74 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall1Q9ER74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sall1Q9ER74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall1Q9ER74 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall1Q9ER74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall1Q9ER74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall1Q9ER74 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sall1Q9ER74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sall1Q9ER74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sall1Q9ER74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall1Q9ER74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall1Q9ER74 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall1Q9ER74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sall1Q9ER74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sall1Q9ER74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall1Q9ER74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sall1Q9ER74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sall1Q9ER74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sall1Q9ER74 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall1Q9ER74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall1Q9ER74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall1Q9ER74 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sall1Q9ER74 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sall1Q9ER74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms