Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr1Q9EPQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr1Q9EPQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr1Q9EPQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr1Q9EPQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr1Q9EPQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr1Q9EPQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr1Q9EPQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr1Q9EPQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr1Q9EPQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr1Q9EPQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr1Q9EPQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr1Q9EPQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr1Q9EPQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms