Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D8Q6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D8Q6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8Q6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D8Q6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D8Q6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8Q6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8Q6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8Q6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D8Q6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8Q6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8Q6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8Q6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8Q6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D8Q6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D8Q6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D8Q6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D8Q6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D8Q6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8Q6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8Q6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D8Q6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms