Protein–RNA interactions for Protein: Q9D871

Ceacam18, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam18Q9D871 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ceacam18Q9D871 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam18Q9D871 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam18Q9D871 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ceacam18Q9D871 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam18Q9D871 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam18Q9D871 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ceacam18Q9D871 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ceacam18Q9D871 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ceacam18Q9D871 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ceacam18Q9D871 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ceacam18Q9D871 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ceacam18Q9D871 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ceacam18Q9D871 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ceacam18Q9D871 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ceacam18Q9D871 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ceacam18Q9D871 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ceacam18Q9D871 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ceacam18Q9D871 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ceacam18Q9D871 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ceacam18Q9D871 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms