Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc81Q9D5W4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc81Q9D5W4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc81Q9D5W4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc81Q9D5W4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc81Q9D5W4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc81Q9D5W4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc81Q9D5W4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc81Q9D5W4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc81Q9D5W4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc81Q9D5W4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc81Q9D5W4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc81Q9D5W4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc81Q9D5W4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc81Q9D5W4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc81Q9D5W4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc81Q9D5W4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc81Q9D5W4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc81Q9D5W4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc81Q9D5W4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc81Q9D5W4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc81Q9D5W4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc81Q9D5W4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc81Q9D5W4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc81Q9D5W4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc81Q9D5W4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc81Q9D5W4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc81Q9D5W4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc81Q9D5W4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc81Q9D5W4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc81Q9D5W4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc81Q9D5W4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc81Q9D5W4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc81Q9D5W4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc81Q9D5W4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc81Q9D5W4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc81Q9D5W4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc81Q9D5W4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc81Q9D5W4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc81Q9D5W4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc81Q9D5W4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc81Q9D5W4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc81Q9D5W4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc81Q9D5W4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc81Q9D5W4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc81Q9D5W4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc81Q9D5W4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc81Q9D5W4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc81Q9D5W4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc81Q9D5W4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc81Q9D5W4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc81Q9D5W4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc81Q9D5W4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc81Q9D5W4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc81Q9D5W4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms