Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zc2hc1bQ9D534 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zc2hc1bQ9D534 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zc2hc1bQ9D534 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zc2hc1bQ9D534 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zc2hc1bQ9D534 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zc2hc1bQ9D534 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zc2hc1bQ9D534 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zc2hc1bQ9D534 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zc2hc1bQ9D534 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zc2hc1bQ9D534 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zc2hc1bQ9D534 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Zc2hc1bQ9D534 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Zc2hc1bQ9D534 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zc2hc1bQ9D534 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc2hc1bQ9D534 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc2hc1bQ9D534 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc2hc1bQ9D534 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc2hc1bQ9D534 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc2hc1bQ9D534 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc2hc1bQ9D534 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Zc2hc1bQ9D534 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zc2hc1bQ9D534 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zc2hc1bQ9D534 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zc2hc1bQ9D534 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms