Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4X6

Samt4, Spermatogenesis-associated multipass transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt4Q9D4X6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samt4Q9D4X6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Samt4Q9D4X6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samt4Q9D4X6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samt4Q9D4X6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samt4Q9D4X6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samt4Q9D4X6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Samt4Q9D4X6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samt4Q9D4X6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samt4Q9D4X6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samt4Q9D4X6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samt4Q9D4X6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samt4Q9D4X6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samt4Q9D4X6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samt4Q9D4X6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Samt4Q9D4X6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samt4Q9D4X6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samt4Q9D4X6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samt4Q9D4X6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samt4Q9D4X6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samt4Q9D4X6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samt4Q9D4X6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samt4Q9D4X6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samt4Q9D4X6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samt4Q9D4X6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samt4Q9D4X6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samt4Q9D4X6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms