Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phf6Q9D4J7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phf6Q9D4J7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phf6Q9D4J7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Phf6Q9D4J7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phf6Q9D4J7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf6Q9D4J7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phf6Q9D4J7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phf6Q9D4J7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phf6Q9D4J7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phf6Q9D4J7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phf6Q9D4J7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phf6Q9D4J7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phf6Q9D4J7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phf6Q9D4J7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phf6Q9D4J7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phf6Q9D4J7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phf6Q9D4J7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Phf6Q9D4J7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Phf6Q9D4J7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phf6Q9D4J7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Phf6Q9D4J7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phf6Q9D4J7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phf6Q9D4J7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phf6Q9D4J7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phf6Q9D4J7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phf6Q9D4J7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phf6Q9D4J7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phf6Q9D4J7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf6Q9D4J7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phf6Q9D4J7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf6Q9D4J7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf6Q9D4J7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phf6Q9D4J7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phf6Q9D4J7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phf6Q9D4J7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Phf6Q9D4J7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phf6Q9D4J7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phf6Q9D4J7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phf6Q9D4J7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phf6Q9D4J7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phf6Q9D4J7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phf6Q9D4J7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Phf6Q9D4J7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf6Q9D4J7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf6Q9D4J7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phf6Q9D4J7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf6Q9D4J7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms