Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2cQ9D1C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ube2cQ9D1C1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2cQ9D1C1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2cQ9D1C1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2cQ9D1C1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2cQ9D1C1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2cQ9D1C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms