Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift27Q9D0P8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift27Q9D0P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift27Q9D0P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift27Q9D0P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift27Q9D0P8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift27Q9D0P8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift27Q9D0P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift27Q9D0P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift27Q9D0P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift27Q9D0P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift27Q9D0P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift27Q9D0P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift27Q9D0P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift27Q9D0P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift27Q9D0P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift27Q9D0P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift27Q9D0P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift27Q9D0P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift27Q9D0P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms