Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem88Q9D0N8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem88Q9D0N8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem88Q9D0N8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem88Q9D0N8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem88Q9D0N8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem88Q9D0N8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem88Q9D0N8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem88Q9D0N8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem88Q9D0N8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem88Q9D0N8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem88Q9D0N8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem88Q9D0N8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem88Q9D0N8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem88Q9D0N8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem88Q9D0N8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem88Q9D0N8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem88Q9D0N8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem88Q9D0N8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms