Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Malsu1Q9CWV0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Malsu1Q9CWV0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Malsu1Q9CWV0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Malsu1Q9CWV0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Malsu1Q9CWV0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Malsu1Q9CWV0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Malsu1Q9CWV0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Malsu1Q9CWV0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Malsu1Q9CWV0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Malsu1Q9CWV0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Malsu1Q9CWV0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms