Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctrb1Q9CR35 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctrb1Q9CR35 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctrb1Q9CR35 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctrb1Q9CR35 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctrb1Q9CR35 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctrb1Q9CR35 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctrb1Q9CR35 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctrb1Q9CR35 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctrb1Q9CR35 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctrb1Q9CR35 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctrb1Q9CR35 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctrb1Q9CR35 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctrb1Q9CR35 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctrb1Q9CR35 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctrb1Q9CR35 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctrb1Q9CR35 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctrb1Q9CR35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctrb1Q9CR35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctrb1Q9CR35 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctrb1Q9CR35 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctrb1Q9CR35 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctrb1Q9CR35 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctrb1Q9CR35 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctrb1Q9CR35 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctrb1Q9CR35 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctrb1Q9CR35 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctrb1Q9CR35 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctrb1Q9CR35 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctrb1Q9CR35 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctrb1Q9CR35 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctrb1Q9CR35 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctrb1Q9CR35 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctrb1Q9CR35 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctrb1Q9CR35 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctrb1Q9CR35 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms