Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifitm3Q9CQW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifitm3Q9CQW9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifitm3Q9CQW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifitm3Q9CQW9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifitm3Q9CQW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifitm3Q9CQW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifitm3Q9CQW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifitm3Q9CQW9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifitm3Q9CQW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifitm3Q9CQW9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifitm3Q9CQW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifitm3Q9CQW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifitm3Q9CQW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifitm3Q9CQW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifitm3Q9CQW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifitm3Q9CQW9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifitm3Q9CQW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifitm3Q9CQW9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifitm3Q9CQW9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifitm3Q9CQW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifitm3Q9CQW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifitm3Q9CQW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifitm3Q9CQW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifitm3Q9CQW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifitm3Q9CQW9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifitm3Q9CQW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifitm3Q9CQW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifitm3Q9CQW9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifitm3Q9CQW9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifitm3Q9CQW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifitm3Q9CQW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifitm3Q9CQW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifitm3Q9CQW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms