Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txndc17Q9CQM5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc17Q9CQM5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc17Q9CQM5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc17Q9CQM5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txndc17Q9CQM5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Txndc17Q9CQM5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc17Q9CQM5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Txndc17Q9CQM5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc17Q9CQM5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc17Q9CQM5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Txndc17Q9CQM5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Txndc17Q9CQM5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Txndc17Q9CQM5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Txndc17Q9CQM5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txndc17Q9CQM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Txndc17Q9CQM5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Txndc17Q9CQM5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Txndc17Q9CQM5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txndc17Q9CQM5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txndc17Q9CQM5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms