Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cntnap2Q9CPW0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cntnap2Q9CPW0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cntnap2Q9CPW0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cntnap2Q9CPW0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cntnap2Q9CPW0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cntnap2Q9CPW0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cntnap2Q9CPW0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cntnap2Q9CPW0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cntnap2Q9CPW0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cntnap2Q9CPW0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cntnap2Q9CPW0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cntnap2Q9CPW0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cntnap2Q9CPW0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cntnap2Q9CPW0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cntnap2Q9CPW0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cntnap2Q9CPW0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cntnap2Q9CPW0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cntnap2Q9CPW0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cntnap2Q9CPW0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cntnap2Q9CPW0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cntnap2Q9CPW0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cntnap2Q9CPW0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cntnap2Q9CPW0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cntnap2Q9CPW0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cntnap2Q9CPW0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cntnap2Q9CPW0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cntnap2Q9CPW0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cntnap2Q9CPW0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cntnap2Q9CPW0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cntnap2Q9CPW0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cntnap2Q9CPW0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cntnap2Q9CPW0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cntnap2Q9CPW0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cntnap2Q9CPW0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cntnap2Q9CPW0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cntnap2Q9CPW0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cntnap2Q9CPW0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap2Q9CPW0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cntnap2Q9CPW0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cntnap2Q9CPW0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cntnap2Q9CPW0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cntnap2Q9CPW0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cntnap2Q9CPW0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cntnap2Q9CPW0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cntnap2Q9CPW0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Cntnap2Q9CPW0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cntnap2Q9CPW0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cntnap2Q9CPW0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms