Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXQ1Q9C009 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXQ1Q9C009 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXQ1Q9C009 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXQ1Q9C009 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXQ1Q9C009 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXQ1Q9C009 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXQ1Q9C009 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXQ1Q9C009 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXQ1Q9C009 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXQ1Q9C009 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXQ1Q9C009 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXQ1Q9C009 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXQ1Q9C009 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXQ1Q9C009 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXQ1Q9C009 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXQ1Q9C009 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXQ1Q9C009 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXQ1Q9C009 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXQ1Q9C009 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXQ1Q9C009 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXQ1Q9C009 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXQ1Q9C009 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXQ1Q9C009 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXQ1Q9C009 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXQ1Q9C009 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXQ1Q9C009 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXQ1Q9C009 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FOXQ1Q9C009 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXQ1Q9C009 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXQ1Q9C009 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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