Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPS2Q9BXY5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPS2Q9BXY5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPS2Q9BXY5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPS2Q9BXY5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPS2Q9BXY5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPS2Q9BXY5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPS2Q9BXY5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPS2Q9BXY5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPS2Q9BXY5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPS2Q9BXY5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPS2Q9BXY5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPS2Q9BXY5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPS2Q9BXY5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPS2Q9BXY5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPS2Q9BXY5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPS2Q9BXY5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPS2Q9BXY5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPS2Q9BXY5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPS2Q9BXY5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPS2Q9BXY5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPS2Q9BXY5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms