Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YIPF2Q9BWQ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
YIPF2Q9BWQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YIPF2Q9BWQ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YIPF2Q9BWQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YIPF2Q9BWQ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF2Q9BWQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF2Q9BWQ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF2Q9BWQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF2Q9BWQ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms