Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM208Q9BTX3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM208Q9BTX3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM208Q9BTX3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM208Q9BTX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM208Q9BTX3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM208Q9BTX3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM208Q9BTX3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms