Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF4Q9BQW3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF4Q9BQW3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF4Q9BQW3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF4Q9BQW3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF4Q9BQW3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF4Q9BQW3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF4Q9BQW3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF4Q9BQW3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF4Q9BQW3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF4Q9BQW3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF4Q9BQW3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF4Q9BQW3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF4Q9BQW3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF4Q9BQW3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF4Q9BQW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EBF4Q9BQW3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EBF4Q9BQW3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EBF4Q9BQW3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF4Q9BQW3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF4Q9BQW3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF4Q9BQW3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms