Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4rQ99PI8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4rQ99PI8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4rQ99PI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4rQ99PI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4rQ99PI8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4rQ99PI8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtn4rQ99PI8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtn4rQ99PI8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4rQ99PI8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4rQ99PI8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4rQ99PI8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4rQ99PI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4rQ99PI8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4rQ99PI8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4rQ99PI8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4rQ99PI8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4rQ99PI8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4rQ99PI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4rQ99PI8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4rQ99PI8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtn4rQ99PI8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtn4rQ99PI8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtn4rQ99PI8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4rQ99PI8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms