Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rassf3Q99P51 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rassf3Q99P51 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rassf3Q99P51 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rassf3Q99P51 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rassf3Q99P51 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rassf3Q99P51 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rassf3Q99P51 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rassf3Q99P51 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rassf3Q99P51 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rassf3Q99P51 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rassf3Q99P51 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rassf3Q99P51 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rassf3Q99P51 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rassf3Q99P51 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rassf3Q99P51 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rassf3Q99P51 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rassf3Q99P51 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rassf3Q99P51 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rassf3Q99P51 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rassf3Q99P51 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rassf3Q99P51 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rassf3Q99P51 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rassf3Q99P51 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rassf3Q99P51 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rassf3Q99P51 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rassf3Q99P51 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rassf3Q99P51 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rassf3Q99P51 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rassf3Q99P51 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rassf3Q99P51 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rassf3Q99P51 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rassf3Q99P51 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rassf3Q99P51 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rassf3Q99P51 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rassf3Q99P51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rassf3Q99P51 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rassf3Q99P51 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rassf3Q99P51 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rassf3Q99P51 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rassf3Q99P51 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rassf3Q99P51 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rassf3Q99P51 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rassf3Q99P51 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rassf3Q99P51 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rassf3Q99P51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rassf3Q99P51 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rassf3Q99P51 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms