Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gins4Q99LZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins4Q99LZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gins4Q99LZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gins4Q99LZ3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gins4Q99LZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gins4Q99LZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gins4Q99LZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gins4Q99LZ3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gins4Q99LZ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gins4Q99LZ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gins4Q99LZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gins4Q99LZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gins4Q99LZ3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gins4Q99LZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gins4Q99LZ3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms