Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Clcc1Q99LI2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clcc1Q99LI2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcc1Q99LI2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcc1Q99LI2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcc1Q99LI2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcc1Q99LI2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clcc1Q99LI2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcc1Q99LI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcc1Q99LI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clcc1Q99LI2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clcc1Q99LI2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clcc1Q99LI2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clcc1Q99LI2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcc1Q99LI2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcc1Q99LI2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcc1Q99LI2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clcc1Q99LI2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clcc1Q99LI2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcc1Q99LI2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcc1Q99LI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clcc1Q99LI2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcc1Q99LI2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcc1Q99LI2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clcc1Q99LI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clcc1Q99LI2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcc1Q99LI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcc1Q99LI2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcc1Q99LI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcc1Q99LI2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcc1Q99LI2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcc1Q99LI2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcc1Q99LI2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcc1Q99LI2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcc1Q99LI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcc1Q99LI2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcc1Q99LI2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcc1Q99LI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcc1Q99LI2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcc1Q99LI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcc1Q99LI2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcc1Q99LI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcc1Q99LI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcc1Q99LI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcc1Q99LI2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms