Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAL3ST1Q99999 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAL3ST1Q99999 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAL3ST1Q99999 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAL3ST1Q99999 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GAL3ST1Q99999 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAL3ST1Q99999 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GAL3ST1Q99999 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GAL3ST1Q99999 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GAL3ST1Q99999 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAL3ST1Q99999 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAL3ST1Q99999 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GAL3ST1Q99999 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GAL3ST1Q99999 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAL3ST1Q99999 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms