Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPNE1Q99829 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPNE1Q99829 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPNE1Q99829 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPNE1Q99829 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE1Q99829 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE1Q99829 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE1Q99829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE1Q99829 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPNE1Q99829 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CPNE1Q99829 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CPNE1Q99829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPNE1Q99829 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPNE1Q99829 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPNE1Q99829 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPNE1Q99829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPNE1Q99829 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPNE1Q99829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPNE1Q99829 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPNE1Q99829 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPNE1Q99829 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPNE1Q99829 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPNE1Q99829 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPNE1Q99829 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPNE1Q99829 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms