Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN2Q99700 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN2Q99700 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN2Q99700 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN2Q99700 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms