Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CDC5LQ99459 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDC5LQ99459 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDC5LQ99459 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDC5LQ99459 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDC5LQ99459 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDC5LQ99459 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CDC5LQ99459 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDC5LQ99459 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDC5LQ99459 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDC5LQ99459 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDC5LQ99459 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDC5LQ99459 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDC5LQ99459 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDC5LQ99459 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDC5LQ99459 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDC5LQ99459 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDC5LQ99459 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDC5LQ99459 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDC5LQ99459 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDC5LQ99459 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDC5LQ99459 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDC5LQ99459 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDC5LQ99459 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CDC5LQ99459 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CDC5LQ99459 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDC5LQ99459 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CDC5LQ99459 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDC5LQ99459 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC5LQ99459 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC5LQ99459 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC5LQ99459 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC5LQ99459 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDC5LQ99459 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC5LQ99459 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC5LQ99459 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC5LQ99459 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC5LQ99459 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDC5LQ99459 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC5LQ99459 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC5LQ99459 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC5LQ99459 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms