Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF3RQ99062 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSF3RQ99062 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSF3RQ99062 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSF3RQ99062 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSF3RQ99062 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSF3RQ99062 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSF3RQ99062 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSF3RQ99062 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF3RQ99062 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF3RQ99062 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSF3RQ99062 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSF3RQ99062 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSF3RQ99062 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF3RQ99062 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF3RQ99062 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF3RQ99062 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms