Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRPK1Q96SB4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRPK1Q96SB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRPK1Q96SB4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK1Q96SB4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK1Q96SB4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK1Q96SB4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK1Q96SB4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK1Q96SB4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK1Q96SB4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK1Q96SB4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRPK1Q96SB4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRPK1Q96SB4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRPK1Q96SB4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRPK1Q96SB4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRPK1Q96SB4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms