Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCC1Q96S66 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCC1Q96S66 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCC1Q96S66 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCC1Q96S66 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCC1Q96S66 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCC1Q96S66 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCC1Q96S66 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCC1Q96S66 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCC1Q96S66 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCC1Q96S66 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCC1Q96S66 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCC1Q96S66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCC1Q96S66 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms